Muzeum patří mezi nejstarší muzea v České republice (vzniklo v r. 1892).
Je významným badatelským centrem s celostátním dosahem orientovaným na dějiny českého školství, pedagogiky, učitelstva a vzdělanosti v návaznosti na život, dílo a odkaz J. A. Komenského; věnuje se rovněž dokumentaci těchto oborů. Je jediným českým pedagogickým muzeem, které se na centrální úrovni komplexně zabývá dějinami školství, učitelstva a vzdělanosti.
Rovněž prezentuje současné školství v historickém kontextu a pomáhá budovat prestiž českého školství a jeho pracovníků před veřejností doma i v zahraničí. Zároveň zdůrazňuje historickou roli studentů a pedagogů ve vzdělávání. Tomuto tématu se věnuje zejména stálá interaktivní expozice Odkaz J. A. Komenského. Tradice a výzvy české vzdělanosti Evropě (více naleznete na stránce Stálá expozice).