Struktura Sbírky NPMK podle Centrální evidence sbírek (CES)
- historická podsbírka (součástí je fond školních obrazů, grafiky, tisky, umělecké předměty a plakáty)
správce Mgr. Michaela Vávrová - knihy (nejstarší sbírkové předměty pocházejí ze 16. století, největší část mapuje vývoj školství v 19. a 20. stol., součástí je i fond komenián a komeniologické literatury)
správce Mgr. Martina Halířová, Ph.D. - fotografie, filmy, videozáznamy a jiná obrazová nebo zvuková média (obsahuje fotodokumentaci interiérů a exteriérů škol, vyučování a život na všech typech škol, portréty významných osobností české i světové pedagogiky od pol. 19. stol. do současnosti)
správce Ing. Svatava Cigánková - písemnosti a tisky (dokumenty k činnosti škol, doklady k životu a dílu významných pedagogů, dokumenty věnované životu a dílu J. A. Komenského)
správce Mgr. Jana Bartošová - školní pomůcky a inventář (trojrozměrné školní pomůcky a inventář)
- mapy (závěsné i nezávěsné mapy)
správce PhDr. Jan Šimek, Ph. D.